Bezpośrednie połączenia kolejowe z Krakowa, Katowic i Rzeszowa do CPK stoją pod znakiem zapytania. Pierwotnie plany zakładały, że większość pociągów z południa Polski będzie przejeżdżać pod przyszłym lotniskiem, które ma stać się kluczowym węzłem komunikacyjnym w Polsce. Tymczasem obecnie wszystko wskazuje na to, że konieczna będzie przesiadka w Warszawie.